专栏名称: 生信钱同学
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真漂亮,这是这个月华大空间技术的第二篇Cell了,看看他们的3D时空建模框架——Spateo

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-11-14 07:00
    

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本篇文章的代码,已经在github上了 (https://github.com/aristoteleo/spateo-release) 近日,一项由华大基因(BGI)及其多家国际研究机构共同合作的前沿研究登上国际顶级期刊《Cell》, 揭示了他们最新开发的3D时空建模框架——Spateo 。这一创新性技术不仅为研究生物胚胎发育的空间动态提供了前所未有的分辨率,还为解析细胞间相互作用和分子信号通路的时空变化开辟了全新的视角。这项研究聚焦于小鼠胚胎从E9.5到E11.5这两个关键发育阶段的分子全息图重建,涉及超过800万细胞的数据,展示了其在胚胎学和发育生物学领域的潜力。 Spateo技术亮点 全面的3D重建与时空动态分析 Spateo首次实现了对整个小鼠胚胎的3D重建,捕捉到从细胞层面到器官层面的空间梯度和信号传递动态。 通过高效的非刚性对齐、多切片优化及网格校正,Spateo显著提升了3D建模的准确性 ………………………………

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