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Nat Genet | 69 个拟南芥泛基因组图谱揭示了全球物种范围内的保守基因组结构

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-05-19 21:00
    

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文章题目 : A pan-genome of 69 Arabidopsis thaliana accessions reveals a conserved genome structure throughout the global species range 杂志: Nature Genetics 影响因子: 30.8 发表时间: 2024.04 文章链接: https://www.nature.com/articles/s41588-024-01715-9 摘要 虽然最初主要是用于功能生物学,但由于其广泛的地理分布和对不同环境的适应,拟南芥已经成为了种群基因组学中一个强大的模型。在这里,呈现了来自 全球物种范围的 69 个群体的染色体水平的基因组组装 。发现即使在地理上和遗传上距离很远的群体中, 基因组的同源性都是非常保守的 。沿着染色体臂,Mb级别的重排很少见,通常只存在于单个群体中。这表明染色体核型是准固定的, 染色体臂上的重排受到了反选择 。着丝粒区域显示出更高的结构动态性,并且核心着丝粒区域的差异占据了大部分基因组大小的变异。泛基因组分 ………………………………

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