ChIPBase v3.0：一个数据库带你玩转转录调控

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转录组研究旨在揭示基因表达调控的复杂网络，而转录调控机制在其中扮演着至关重要的角色。非编码RNA（ncRNA）和蛋白编码基因（PCG）的转录调控涉及多种因子，包括转录因子和组蛋白修饰等。这些调控因子通过与DNA的相互作用，影响着基因的表达水平，进而参与各种生物学过程。 ChIPBase数据库致力于研究转录因子结合位点和基序，从ChIP-seq数据解码lncRNAs、miRNAs、其他ncRNAs和蛋白质编码基因的转录调控网络，最新的ChIPBase v3.0 版本更是在数据量、功能和特性方面都取得了显著进步 （ https://rnasysu.com/chipbase3/index.php ） ： 庞大的数据集: 整合了来自ENCODE、ReMap、CistromeDB和GEO等数据库的约55,000个ChIP-seq数据集，涵盖了多种细胞系、组织和实验条件。 全面的调控关系: 建立了约1.51亿个调控关系，涉及约171,600个基因和3,000种调控因子，包括lncRNA、miRNA、其 ………………………………