数据库介绍 | CROST：一个全面的空间转录组学数据库

主要观点总结

本文介绍了CROST这一全面的空间转录组学数据库的特点和功能，包含多种空间转录组数据集，提供了浏览、搜索、分析和下载所需信息的工具。

关键观点总结

关键观点1: CROST是一个全面的空间转录组学资料库，涵盖了高质量样本，收录了来自不同物种、器官和疾病的182个空间转录组数据集。

包括1033个子数据集和48043个肿瘤相关空间可变基因(SVGs)。还整合了单细胞RNA测序数据去卷积空间转录组数据，并评估了相关性、共定位、细胞间通讯以及生物功能注释分析。

关键观点2: CROST提供了浏览模块、癌症SVG模块、探索模块和在线分析模块等多个功能模块。

用户可以通过这些模块方便地获取数据、进行数据分析、可视化以及细胞类型注释等。此外，还有互动环境进行可视化探索细胞间相互作用和信号传导机制。

关键观点3: CROST集成了空间转录组数据与其他组学数据，如经典转录组、表观基因组和基因组数据。

通过综合这些数据，CROST能够更全面地阐述SVG在癌症进展和预后中的作用。