bioRxiv｜利用生成式AI进行初级结构生物学建模

文章预览

2024年5月13日，来自罗格斯大学、罗格斯癌症研究所、罗格斯新泽西医学院的研究人员在bioRxiv上发表文章Generative artificial intelligence performs rudimentary structural biology modeling。 本文探索了GPT-4在初级结构生物学建模中的应用，包括为20个标准氨基酸和α螺旋多肽链建立三维结构模型，以及分析药物与其靶标蛋白之间的相互作用。尽管建模过程中存在偶尔的错误，且对复杂分子的容忍度有限，但GPT-4生成的结构几何参数通常接近实验参考值。此外， GPT-4还能识别参与配体结合的特定氨基酸残基及相应键距，展示了其在原子尺度精度下进行基本结构生物学建模和相互作用分析的能力 。 背景 近年来，基于人工智能的科研能力和应用取得了显著进展。在蛋白质结构预测领域，AlphaFold2和RoseTTAFold等基于AI的专用工具已经取得了令人瞩目的成果，它们能够以高精度对 ………………………………