专栏名称: 单细胞天地
对应生信技能树论坛›研究热点›单细胞测序版块,力求全方位收集整理分享单细胞测序数据的应用,涵盖多种组学,多种疾病,发育机理,药物开发等等
目录
相关文章推荐
今天看啥  ›  专栏  ›  单细胞天地

分别提供多个样本的count文件和meta单细胞数据如何读取并创建Seurat对象

单细胞天地  · 公众号  ·  · 2025-02-28 22:50
    

文章预览

我们生信技能树的生信马拉松授课答疑群群里有个小伙伴在群里提问题, GEO一个数据集提供了多个单细胞样本,如果只选取其中一部分,那怎么读取并进行降维聚类分群呢? 插个广告: 最新一期生信入门课就在下周一,还没上车的小伙伴可以关注一下呀,我们可以提供超体贴的答疑 : 生信入门 & 数据挖掘线上直播课3月班 数据情况 数据集是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE197626 GSE197626_RAW.tar附件中总共有这么多样本: GSM5924054_iri+nx_day30_rep1_counts.txt.gz 19.9 Mb GSM5924054_iri+nx_day30_rep1_data.txt.gz 159.7 Mb GSM5924054_iri+nx_day30_rep1_metadata.txt.gz 131.7 Kb GSM5924054_iri+nx_day30_rep1_scale_data.txt.gz 170.6 Mb GSM5924055_u-iri_day30_rep1_counts.txt.gz 13.3 Mb GSM5924055_u-iri_day30_rep1_data.txt.gz 97.2 Mb GSM5924055_u-iri_day30_rep1_metadata.txt.gz 93.7 Kb GSM5924055_u-iri_day30_rep1_scale_data.txt.gz 11 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览