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深挖转录组 之 如何构建共表达网络(一)

生信百科  · 公众号  · 医学  · 2017-08-07 10:00
    

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有小伙伴们建议把Cytoscape 讲一讲,那我们今天我们先来学习共表达网络的第一部分:如何筛选共表达基因对! 照例回顾 MEV 聚类—助力转录组分析,成就大paper! 这篇算是转录组后期分析的一种思路! 好像木有其他相关文章,好吧,今天的就算是第一篇! 本人之前一直写基因组的文章,貌似近几年关注度不是特别高啊,反而转录组的,群体的关注度相当高,那我也分享些相关内容,来! 共表达网络定义 往往整个转录组中许多基因通常是同时表达的,表达趋势一致。那么问题来了,什么基因倾向于共表达呢?为什么要共表达呢?如何找到趋势一致的基因呢?(看回顾中的聚类文章)。 共表达的基因往往共同调控一类代谢过程,或者被某些转录因子共调控,所以 ………………………………

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