看啥推荐读物
专栏名称: 生信宝典
生物信息分析入门、晋级和经验分享。Linux、R、Python学习教程;高通量测序数据分析学习教程;生信软件安装教程。所有内容均为原创分享,致力于从基础学习到提高整个过程。
目录
相关文章推荐
生信宝典  ·  Plant Com | ...·  4 天前  
生物探索  ·  EHJ | ...·  1 周前  
BioArt  ·  Nature | ...·  1 周前  
今天看啥  ›  专栏  ›  生信宝典

如果不是没有钱,谁想测3个重复?

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2020-03-29 08:20
这篇文章上次发出后,有朋友留言说到底要测几个重复?其实也没有定论,有钱多多益善。只是需要知道重复少时,发现的差异基因会有不少假阴性,获得不了结果时,可尝试加测一些,可获得更稳定的结果。重复少时,抽样随机性大。如下图随机抽取2个生物重复获得的差异基因数目最多时是最少时的5倍以上;随机抽取3个生物重复获得的差异基因数目最多时是最少时的3倍左右。2016年英国邓迪大学的Geoffrey J Barton教授在RNA发表一篇文章专门评估这一问题。作者对野生型和snf2突变型酵母样品分别测序了48个生物学重复;质控后,野生型样品保留42个生物学重复,突变型样品剩余44个生物学重复。在控制假阳性率为0.05的标准下,用所有可用生物重复计算出的差 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照