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Rosetta系列-FloppyTail构建蛋白柔性尾

生信杂谈  · 公众号  ·  · 2018-04-11 18:53
转载请联系,且保留链接使用这个代码需要蛋白具有长的柔性尾,在晶体结构中是缺失的,生物化学证据表明已知结合伴侣上尾部的特定结合位点.该代码旨在模拟长柔性尾巴的范围并确定假设的结合位点是否合理。该工具更有用于测试关于可能的构象的假设,并探索可用的构象空间,而不是找到“唯一真正的结合模式”。 如果你的尾巴真的很灵活,它可能没有一个“真正的结合模式”。代码和演示代码位于 rosetta/main/source/src/apps/public/scenarios/FloppyTail/演示位于 rosetta/main/tests/integration/tests/FloppyTail/FloppyTail哲学-怎么解决问题FloppyTail旨在“约束对接”。 当你有一个或多个相对刚性的结构时,可以使用它,并用linker链接。 对于一些情况,如最初的柔性尾巴,问题是“ ………………………………

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