AlphaFold的盲区，RareFold的主场：29种非天然氨基酸全建模无压力

文章预览

/  🧬突破蛋白设计“20 种氨基酸”限制：RareFold 带你进入非天然世界  /     🚀摘要速览：结构预测不再只靠 20 种氨基酸！ 你有没有想过，AlphaFold 虽然强大，但它只能处理我们熟知的 20 种“天然”氨基酸。而真实的自然界和合成生物学世界远比这丰富： 超过 500 种氨基酸类型早已被发现 ，其中140 种非天然氨基酸（NCAA）能天然整合进蛋白质中——它们的潜力几乎未被探索！ 本月最新发布的预印本《RareFold》提出了一个划时代的解决方案： 一个支持非天然氨基酸结构预测与设计的深度学习模型 ，为新一代蛋白质药物设计开辟了新的方向。     🔬01｜RareFold 是什么？ RareFold 是一个以  AlphaFold2 EvoFormer 架构为基础 构建的蛋白结构预测模型，支持： ✅  20 种天然氨基酸 + 29 种常见非天然氨基酸 ✅ 每种氨基酸作为一个独立 token 表征，避免“X”掩盖 ………………………………