NAR｜吕青/张雅鸥团队合作发表设计敲除长非编码RNA的利器——LncRNAway

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2024年5月21日 医麦客新闻 eMedClub News 长非编码RNA（lncRNA）被定义为长度超过200个核苷酸的RNA转录物，通常不具有编码蛋白质的能力。根据GENECODE V30版本，已注释出16193个lncRNA基因和30369个lncRNA转录产物。过去十年的研究表明，lncRNA在各种生物学和病理过程中扮演着至关重要和多功能的角色。然而，这些已注释的lncRNA中只有一小部分进行了功能性研究。 在过去几年中，已经推出了几种基于网络的sgRNA设计工具，如 CRISPOR 、 E-CRISP 、 CRISPick 、 CRISPR-ERA 和 CHOPCHOP 等。这些网络工具致力于计算不同Cas蛋白的 CRISPR-KO/KI 、CRISPRa/i的sgRNA。然而，它们更多关注优化sgRNA筛选方法，从而提高特异性和减少脱靶效应。虽然像 CRISPR-ERA 和 CRISPick 这样的工具可以生成用于抑制lncRNA的sgRNA，但它们采用的算法倾向于针对蛋白编码基因。由于这种方法会去除大片段的DNA，因此 ………………………………