专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

首篇TCellAtlas 数据库以及T细胞自动注释工具 STCAT(郭安源团队)

生信技能树  · 公众号  ·  · 2025-03-08 20:10
    

文章预览

“ 最近在朋友圈看到 郭安源老师 发一个会议链接(具体见今天的次页),点进去看了一眼一下子就注意到了 他们团队的新作:TCellAtlas 数据库和T细胞自动化注释工具STCAT, 超全的T细胞亚型数据库包含68 T-cell subtypes and states 。 激动,想想看细胞亚群注释可是非常难的啊,各种五花八门的注释方式都有。 那这个工作无疑为我们提供了一个非常全面的T细胞注释参考和行业注释标准,是一个非常有意义的工作! 下面来简单看看~ 数据库网址:https://guolab.wchscu.cn/TCellAtlas/ TCellAtlas 收录了 来自10X Genomics的339个样本共1,677,799个T细胞,以及 Smart-seq测序的47,215个T细胞:共有 68种 T-cell subtypes and states。 数据都可以进行下载 可以按照组织,疾病,收录的项目Project等下载,下载还提供了两种 原始的count.h5ad 以及带有数据处理和注释的 h5ad,真的太棒啦! 还可以上 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览