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3min~插件 | 蛋白序列集合功能注释快速完成 - Quick Protein Anno

生信石头  · 公众号  ·  · 2021-11-06 12:27
写在前面下游数据分析的时候,大体会遇到以下两个场景:手工查看基因组任意位置的基因,具体的注释信息,以及其前后基因的功能注释信息手上有某个序列或者某几个序列,想要快速知道这些序列对应的蛋白到底都有什么功能一般而言,我们会使用BLAST软件,比对到一些数据库,然后整理整理。不过这个过程还是相对较慢。快,估计是所有人都在追求的。要加速这个过程,其实只需要做两个事情:数据库本地化,因为网页总归是慢一些的,尤其是网站主机在国外,比如NCBI使用比BLAST更快的软件,如ghostz或者diamond等对于TBtools用户来说,则可以直接使用今天介绍的插件。Quick Protein Anno安装请参考之前的推文《Plugin | 高速版插件商店!我又有一个绝妙的 idea》。插件打开界面如下:由上述界面可以看出,使用起来极其简单:如果没有下载Swissprot数据 ………………………………

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