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R语言学习 - 线图绘制

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2017-07-08 17:40
线图线图是反映趋势变化的一种方式,其输入数据一般也是一个矩阵。单线图假设有这么一个矩阵,第一列为转录起始位点及其上下游5 kb的区域,第二列为H3K27ac修饰在这些区域的丰度,想绘制一张线图展示。profile="Pos;H3K27ac-5000;8.7-4000;8.4-3000;8.3-2000;7.2-1000;3.60;3.61000;7.12000;8.23000;8.44000;8.55000;8.5"读入数据 (经过前面几篇的联系,这应该都很熟了)profile_text T, row.names=1, quote="",sep=";")profile_text      H3K27ac -5000     8.7 -4000     8.4 -3000     8.3 -2000     7.2 -1000     3.6 0         3.6 1000      7.1 2000      8.2 3000      8.4 4000      8.5 5000      8.5# 在melt时保留位置信息# melt格式是ggplot2画图最喜欢的格式# 好好体会下这个格式,虽然多占用了不少空间,但是确实很方便# 这里可以 ………………………………

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