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样本量爆棚?分析深度加码?选对服务器,省心科研无忧!

生信塔  · 公众号  ·  · 2024-10-31 18:00
    

主要观点总结

文章主要讨论了服务器配置的选择,包括实验室购买和在线租赁的方式,针对不同分析需求如宏基因组测序、单细胞分析和孟德尔分析所需的服务器配置进行了详细说明。同时,推荐了一个生信云服务器,列出了其提供的多种优势和特点。

关键观点总结

关键观点1: 服务器配置的重要性

文章中强调了挑选合适服务器配置的重要性,特别是对于进行生物信息学分析的研究人员来说,内存、线程和存储空间等配置需根据分析需求进行选择。

关键观点2: 不同分析需求对应的服务器配置

文章详细阐述了宏基因组测序、单细胞分析和孟德尔分析等不同生物信息学分析需求所需的服务器配置,指出了内存、线程等资源的合理配置。

关键观点3: 推荐的生信云服务器及其优势

文章推荐了一个生信云服务器,并列出其多种优势,包括配置支持定制、超大硬盘存储空间、高性能独享服务器、一对一指导、高安全性和稳定性以及预装多款软件等。


文章预览

嘿,聊到服务器配置,要是自个儿在实验室买,要记得选那种“高配款”,不然通过设备科升级,那可有的折腾了。未雨绸缪,留点缓冲空间总是明智的。不过嘛,若你在咱们这租个在线服务器,那就轻松多了,开个账户,售后群里喊一嗓子,今天说明天就能用上,跟变魔术似的。 再说宏基因组测序,样本不多时,64线程配256G内存的服务器就游刃有余。但要是样本超过30个,嘿,你就需要提升到96线程,512G内存了。为啥?因为宏基因组测序是个内存大户,组装、去冗余那会儿,算力需求蹭蹭涨,分析复杂度也跟着飙升,需要的软件和数据库支持一个都不能少。 来看看单细胞分析。基础操作,比如读取数据、质控啥的,一个样本大概1万个细胞,占2G内存。样本少于30个的话,72线程配256G内存就够了。不过,如果你想玩深度分析,比如伪时序分析,那 ………………………………

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