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AlphaFold3 能搞定分子胶预测吗?北大团队首评五大共折叠方法!

BioTender  · 公众号  ·  · 2025-05-31 08:25
    

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/  AlphaFold3 能搞定分子胶预测吗?北大团队首评五大共折叠方法!  /     🧩 分子胶(Molecular Glue)到底难在哪? 分子胶是一类单价小分子药物,可以诱导或稳定两个蛋白的结合,形成三元复合物,进而触发蛋白降解或功能调控,尤其适用于“不可成药”的靶点如转录因子、内在无序蛋白。三元复合物结构预测的最大挑战在于: 诱导配体协同结合 :两个蛋白之间本来可能没有亲和力,靠小分子“胶水”诱导。 复杂构象重排 :传统刚性对接或诱导拟合(induced-fit docking)方法难以模拟。 缺乏训练数据 :PDB 中真实的 MG 复合物极少,AI 模型难以泛化。 点击查看原文 AF分子胶预测.pdf     🔬 他们做了什么? 构建数据集 MG-PDB(221 个三元复合物) : 手动从 PDB 中整理非共价 MG 复合物; 包含降解型(MGD)、非降解异源二聚体和同源二聚体三类; 分为 do ………………………………

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