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寻找分子上游机制的模式和方法(一)

i生信  · 公众号  ·  · 2020-03-23 11:10
如果一个分子在疾病组(实验组)是显著高表达的,而我们需要寻找其上调表达的原因,可以有很多层面的角度来考虑,今天我们选的角度是转录因子。关于转录因子,我们在之前就介绍过,简单来说就是这类蛋白通过结合到基因的DNA序列上,调控RNA的转录活性,从而使RNA产生增加或减少,最终蛋白水平也发生变化,而根据我们对转录因子这类蛋白的研究总结,很多转录因子都对特定的识别一些相对保守的序列。因此,我们可以根据他识别序列的保守性来进行预测靶基因。其实转录因子这类蛋白我们常常见到,比如大名鼎鼎的抑癌基因P53,缺氧诱导因子HIF1a,参与干细胞分化的nanog,EMT相关的twist、snail、slug等等,正是因为其能调控一系列分子的表达,所以 ………………………………

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