专栏名称: 生信钱同学
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一会用p-value一会又用adjusted p-values,审稿人会在意这个事吗?看看审稿人怎么...

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-09-12 07:00
    

主要观点总结

本文主要讨论了公众号内容接收问题、数据处理中adjusted p-values和p-value的使用统一问题、如何找到靶基因的上下游的数据库工具以及空间组学的学习内容。文章通过实例解释了如何处理数据中的不一致问题,并介绍了方便的实验数据库工具,强调了空间组学的学习内容。

关键观点总结

关键观点1: 公众号内容接收与数据处理中的不一致问题

文章提到了在处理数据时可能遇到的数据结果不一致问题,如adjusted p-values和p-value的结果差异。对此,审稿人会关注这两者的统一使用,作者需要在文章中保持一致。

关键观点2: 使用KnockTF 2.0数据库查找靶基因上下游关系

文章介绍了如何使用KnockTF 2.0数据库来查找靶基因的上下游关系,该数据库可以大大减少寻找上下游的时间,提高实验效率。

关键观点3:

文章强调了空间组学的学习重要性,并提到了单细胞分辨率空间组学的基础分析方法。此外,文章还提到了病理与空间组学之间的联系越来越紧密,以及AI代码在生信领域的应用。


文章预览

不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效 看到昨天的那篇文章的审稿意见,就看到一件有意思的事。 ( 自己的数据跟公共数据结果不一致怎么办,该怎么解释?单细胞分辨率空间组学能学到哪些分析方法 ) 有时候大家在处理数据的时候,会发现adjusted p-values的结果不显著,而p-value的结果比较好,或者 p-values经过矫正后差异基因/通路明显减少,不符合自己的预期。这个时候可能想用 p-values作为自己的统计结果。其实咱们也能看到很多文章用的是 p-values, 这没啥问题,怕就怕在文中前后不一致,两者交叉着用 。 审稿人还真会问这个事,下面👇就是实例: 审稿人提问:adjusted p-values和p-value在文章中最好统一下 最后作者也都经过纠正了,都统一了下,都用了adjusted p-values。 近期的文章 直击生信痛点,如何找到你的靶基因的上下游 ………………………………

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