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如何下载MSigDB数据库糖代谢相关基因

生信技能树  · 公众号  ·  · 2025-02-06 16:53
    

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我们接到一个生信入门马拉松授课学员的提问,怎么办!!!当然是宠她啊! 提问如下: 首先,我检索了一下相关资料 使用关键词在微信搜索中查找: MSigDB数据库糖代谢相关基因 。搜到一篇 2022 年 10 月发表在 Frontiers in Endocrinology 杂志上的文章: Identification of risk model based on glycolysis-related genes in the metastasis of osteosarcoma 。这个文章中用的是糖酵解相关基因集: We obtained 5 glycolysis-related pathway gene sets from MSigDB, namely: BIOCARTA GLYCOLYSIS PATHWAY GO GLYCOLYTIC PROCES, HALLMARK GLYCOLYSIS, KEGG GLYCOLYSIS GLUCONEOGENESIS, REACTOME GLYCOLYSIS. 我感觉应该不止5个基因集! 又看到了另一篇 2023 年 8 月发表在杂志 Cancer Cell Int 的文献《 Glycolysis-related biomarker TCIRG1 participates in regulation of renal cell carcinoma progression and tumor immune microenvironment by affecting aerobic glycolysis and AKT/mTOR signaling pathway 》 ………………………………

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