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集思广益-生存分析可以随心所欲根据表达量分组吗

生信技能树  · 公众号  ·  · 2019-05-15 12:02
很久以前我们提到过TCGA的各种网页数据库的生存分析结果冲突的问题TCGA数据库生存分析的网页工具哪家强现在又有人提出来一个新的问题,如下: 根据基因表达量的中位值把样本分成高低表达量的组别,然后做生存分析是比较符合大家的直觉的。如果这个时候生存分析结果不具有统计学显著性,而大家又的确感兴趣这个基因在这个癌症的临床意义,会尝试调整分组指标,这也就是为什么网页工具会提供调整阈值的窗口,比如调整为如下所示:image-20190515111829160你会惊奇的发现显著了!!!但是实际上这样30%的阈值来进行分组的操作一定会受到审稿人质疑,基本上没有人这样操作,如果调整为25%的阈值就会发现马上又不显著了。所以这样的KM分析是有弊端的!那COX分析 ………………………………

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