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R语言学习 - 热图美化

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2017-07-03 07:51
    

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热图美化 上一期的绘图命令中,最后一行的操作抹去了之前设定的横轴标记的旋转,最后出来的图比较难看。 上次我们是这么写的 p "samples") + theme_bw() + theme(panel.grid.major = element_blank()) + theme(legend.key=element_blank()) 为了使横轴旋转45度,需要把这句话 theme(axis.text.x=element_text(angle=45,hjust=1, vjust=1)) 放在 theme_bw() 的后面。 p 45,hjust= 1 , vjust= 1 )) 最后的图应该是下边样子的。 上图的测试数据,数值的分布比较均一,相差不是太大,但是Gene_4和Gene_5由于整体的值低于其它的基因,从颜色上看,不仔细看,看不出差别。 实际应用中,异常值的出现会毁掉一张热图,如下是一个例子。 data 5,mean= 5 ), rnorm( 5 ,mean= 20 ), rnorm( 5 , mean= 100 ), c( 600 , 700 , 800 , 900 , 10000 )) data 5, byrow= T ) data ………………………………

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