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Nat Genet | 超泛基因组有助于深入了解鹰嘴豆的物种进化和农艺性状位点,促进作物改良

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2024-05-27 22:37
    

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超泛基因组有助于深入了解鹰嘴豆的物种进化和农艺性状位点,促进作物改良 Khan, A.W., Garg, V., Sun, S. et al. Cicer super-pangenome provides insights into species evolution and agronomic trait loci for crop improvement in chickpea. Nat Genet (2024). https://doi.org/10.1038/s41588-024-01760-4 鹰嘴豆 ( Cicer arietinum  L.) 是一种在干旱和半干旱地区种植的重要豆类作物,其遗传多样性有限。人们正在努力利用其野生近缘种来扩大其多样性,而这些近缘种在很大程度上仍未被开发。在这里,研究团队展示了基于 八个一年生 Cicer 野生物种的从头基因组组装的 Cicer 超泛基因组 。鉴定了24,827个基因家族,其中包括 14,748个核心基因家族、2,958个软核心基因家族、6,212个非必须基因家族和909个物种特异性基因家族 。非必须的基因组富含与关键农艺性状相关的基因。栽培基因组和野生基因组之间的结构变异 ………………………………

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