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表达量差异分析结果的可视化

生信修炼手册  · 公众号  ·  · 2022-05-11 20:27
    

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欢迎关注”生信修炼手册”! 对于任意的表达量数据,定量加差异分析都是一套经典的组合拳。当我们想要展示特定基因的组间差异结果时,下面这种图表就派上了用场 横坐标为基因,纵坐标是基因表达量,每一组的表达量采用了箱体图的形式来展现,当然也可以换成小提琴图等其他描述总体分布的可视化方式。对于每一个基因,通过并列的两组箱体来定性的展示两组间的分布差异,而图中星号则表示差异分析的p值,定量展示差异的显著性,通过这种图表,可以直观的展示差异分析结果。 对于这样的图表,推荐使用ggpubr这个R包,这个包是ggplot2的一个扩展,所以其画图的语法遵循ggplot2的定义,简单理解就是每一个属性都对应数据框的每一列,所以我们首要任务是构建一个绘图用的数据框,这个数据框的每一列对应图中的一个元素 1. 第 ………………………………

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