复旦大学朱思语/漆远等：蛋白质动态结构预测模型AlphaFolding

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蛋白质的功能很大程度上取决于其3D结构。19世纪中期，科学界普遍认为蛋白质结构是固定的、刚性的，类似锁与钥匙模型 (lock-and-key model)，即蛋白质与配体的结合是由固定的三维结构决定的。然而，当Daniel Koshland提出酶与底物结合时会发生构象变化的观点后，传统思维开始受到挑战 。 1980年代，分子动力学模拟 (Molecular Dynamics, MD) 兴起， 首次从计算角度揭示了蛋白质的运动轨迹 ，自此，蛋白质动态结构的功能性作用受到越来越多的重视。对于生物技术研究人员和科学家而言，理解蛋白质运动的动态特征对理解生命过程、研发新型药物都具有重要的意义。 举例而言，G蛋白偶联受体 (GPCR) 是许多药物的主要靶点，占目前FDA批准药物的30%以上。然而，GPCR不是刚性结构，而是具有高度的动态性，不同的构象状态会影响药物结合模式。如果仅基于静态晶体 ………………………………