专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
目录
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

超详细T细胞亚群标记基因列表

生信技能树  · 公众号  ·  · 2025-05-23 22:04
    

文章预览

看到了一个超详细的对T细胞亚群进行分析的文献,分享给大家!参考文献标题: 《Integrated single-cell transcriptome and T cell receptor profiling reveals defects of T cell exhaustion in pulmonary tuberculosis》, 这篇文献于2024年6月发表在 J Infect. 杂志(IF=14.3)上。 下面几张图来自文献: 整理后的: note:下面这两张图来自小红书 按照CD4/CD8/其他T分别分类: R代码版:用的时候可能需要稍微修改一下 ############################### # 创建一个空的list对象 cell_markers # CD4+ T细胞亚群 cell_markers$`Naive T cells` "CCR7" ,  "SELL" ,  "TCF7" ,  "IL7R" ,  "GPR183" ,  "LEF1" ,  "LTB" ) cell_markers$`Central Memory T cells` "CCR7" ,  "HSPA6" ,  "MT1E" ,  "MT1F" ,  "CLDND1" ,  "CD69" ,  "GPR183" ,  "IL7R" ,  "KLF2" ,  "TOB1" ) cell_markers$`Effector Memory T cells` "RPS19" ,  "DUSP2" ,  "CD44" ) cell_markers$`Th1-like T cells` "UCP2" ,  "APCB1B" ,  "TBX21" ,  "IFNG" ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览