刘海燕/陈泉/许洋等Structure：揭示空腔蛋白的从头设计 | Cell Press 对话科学家

生命科学Life science2024年2月6日，中国科学技术大学生命科学与医学部许洋、胡秀红、陈泉、刘海燕等在Cell Press细胞出版社旗下期刊Structure发表了一篇论文，题为“De novo Design of Cavity-containing Proteins with a Backbone-centered Neural Network Energy Function”。该研究基于团队前期研发的统计能量函数SCUBA和ABACUS2从头设计了有空腔的蛋白结构。▲长按图片识别二维码阅读原文酶和小分子结合蛋白等这些蛋白质的一般规律是结构上具有容纳小分子的空腔，并开口于蛋白质表面。因为蛋白质的折叠需要有稳定的疏水核心，空腔一般不利于蛋白质折叠。自然界进化出的包含空腔的蛋白结构有一些特点，如蛋白质整体体积增大、通过蛋白间相互作用在边界形成空腔等。从头设计具有空腔的蛋白质困难较大，以前的研究一般基于已有能产生空腔的整体拓扑来进行结构设计。 近 ………………………………