HyperMPNN ：设计高度耐热蛋白的新策略

文章预览

01 摘要 稳定性是使重组蛋白能够用于治疗或生物技术应用的关键因素。基于深度学习的蛋白质设计方法 ProteinMPNN 在创造新蛋白质或稳定现有蛋白质方面表现出了强大的性能。然而，设计的稳定性不太可能显著超过训练集中的天然蛋白质。因此，从嗜热菌中收集了预测的蛋白质结构，它们的氨基酸组成与嗜热菌有很大的差异。本研究展示了一个对来自嗜热菌的预测蛋白质进行再训练的工具，称为 HyperMPNN ，不仅可以恢复这种独特的氨基酸组成，而且也可以应用于来自非嗜热菌的蛋白质。综上所述，通过对嗜热菌的数据进行自我监督学习，创造了一种设计高度耐热蛋白的新方法。 02 前言 蛋白质在自然界中以功能和稳定性之间的微妙平衡存在，只要功能保持，就可以耐受非理想突变。事实上，蛋白质的某些区域需要在热力学上受到阻碍才能发挥其功能 ………………………………