利用JASPAR进行转录因子结合位点预测

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简介 转录因子  (Transcription Factors ， TFs)  是一类通过结合特定的 DNA 序列，从而调控基因表达的蛋白质。它们在细胞分化、发育、代谢、应激响应以及疾病（如癌症）中发挥关键作用。了解转录因子的结合位点对于揭示基因调控机制、疾病研究和药物开发具有重要意义。 先前我已经做了一个转录因子靶基因预测 APP/R 包（ TF Target finding/TFTF ），广受好评。但是有同学提出，预测出结果之后如何进行后续实验验证，如何获得结合位点，今天以 JASPAR 数据库 Scan 功能做简要介绍。 JASPAR 数据库（ http://jaspar.genereg.net/ ） 是一个广泛使用的转录因子结合位点（ Transcription Factor Binding Sites ， TFBS ）的免费开源数据库，包含了多种物种的转录因子结合位点信息，广泛应用于基因调控研究和功能预测。 步骤 利用 JASPAR 进行转录因子结合位点预测的步骤如下（以人 ………………………………