交互式Pathway分析可视化工具Ipath3介绍

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ipath3 是一款交互式  Pathway  分析可视化工具，它总结了生物系统中的各种代谢通路，节点表示各种生化分子，线表示生化反应。前面已经发布了两个版本，现在已经更新到第三个版本，提供了更多方便的工具，以及更全面的通路图。 Ipath3现有4个大类型的通路图谱： 代谢图 ，包含生物系统中整体代谢。 次级代谢产物图 ，参与次级代谢物生物合成途径的综合。 抗生素 ，包含各种抗生素生物合成过程。 微生物代谢 ，包含各种环境中的微生物代谢。 Ipath可以用于宏基因组或其他微生物代谢分析中，如这篇文献  (PMID:29198031) 中使用  Ipath 找到了微囊藻的代谢参与了的生物途径，如：碳水化合物，氨基酸，能量，脂质代谢等途径的主要途径，并且将其可视化。 Ipath ………………………………