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写在开头 又开始在扒拉之前整理过文献里面好看的图表了,翻到去年一篇比较早期的推文—— 肝细胞癌微血管侵袭单细胞分析研究-1 最开始整理的时候,最先看中的是文献的小清新配色,全文非常统一! 去年也完成了第一层次降维聚类分群—— GSE242889-肝细胞癌微血管侵袭 ,接下来就一起来复现一下文献中好看的图表。 文章简介 文章标题: 《Single-cell dissection of the multicellular ecosystem and molecular features underlying microvascular invasion in HCC》 发表日期和杂志: 2023年发表在Hepatology上 在线阅读链接: https://doi.org/10.1097%2FHEP.0000000000000673 单细胞数据详情: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242889 文章中分析代码: https://github.com/ZhoulabCPH/MVI_HCC 接下来准备基于文献提供的Figure1-2的代码,加上自己的理解复现一下文章的好看图表。 Figure1C简介 UMAP可视化显
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