多位点测序与肿瘤空间进化

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Title Immune-tumor interaction dictates spatially directed evolution of esophageal squamous cell carcinoma Online https://academic.oup.com/nsr/article/11/5/nwae150/7656974 研究背景 食管鳞癌（ESCC）是一种预后较差的癌症，其基因组和肿瘤微环境（TME）具有高度异质性。既往研究多基于单点采样，低估了肿瘤的空间异质性，且对ESCC的进化模式和驱动机制认识不足。本研究通过多区域采样（507个肿瘤样本，来自103例患者）结合多组学分析（全外显子、转录组、甲基化），系统解析了ESCC的空间异质性、进化模式及免疫微环境的作用。 研究方法  患者和样本 ：103例未经辅助治疗的ESCC患者的肿瘤样本（含原发灶461个和淋巴结转移46个），标注空间位置（中心、上/下/左/右侧），同时也去了正常对照样本。 WES测序 ：采用的是 Agilent SureSelect Human All Exon V6 kit ，双端测序，读长 150bp。原发灶中位深 ………………………………