Science杂志：富集结果条形图还可以聚类吗？

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前面我们在学习这篇 2024 年 6 月份发表在 顶刊 science 杂志上的文献《 Defining the KRAS- and ERK-dependent transcriptome in KRAS-mutant cancers 》时，发现里面的图片都很美观，我们可以借来放在自己的科研文章中以提升档次。 前面给大家介绍过的： 一种很新的功能富集结果展示方法 。 Science杂志高颜值GSEA打分排序图 今天再来学习一下文章中对功能富集结果的条形图进行聚类，并且还展示显著性的图。 含义：作者对一组基因 PDAC KRAS-ERK UP essential genes 进行KEGG，GOBP，GOCC 以及 REACTOME 进行 ORA 功能富集分析，根据富集的 pvalue 和 logFC 对通路进行聚类（ ( ? 这个聚类指标很迷惑，图中横坐标展示的是log2FC，但 ORA 富集结果没有这个指标，所以这里我用的-log10(adj. p-val),  故本次绘图的通路聚类在本文中没有特殊含义，纯代码技巧 ）。 图注： Fig. 4. KRAS-ERK–dependent genes ar ………………………………