专栏名称: 生信分析手册
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4+衰老+分型+机器学习+实验,由热点开展分型的经典思路,快来学习!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2025-03-14 18:00
    

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Role of Aging in Ulcerative Colitis Pathogenesis: A Focus on ETS1 as a Promising Biomarker”,这篇文章发表在 J Inflamm Res 期刊上,影响因子为4.2。 结果: UC与正常样品中DEG的鉴定 去除批次效应后,两个数据集中的样本均匀分散,表明获得了可靠的结果(图1A)。在三个数据库中总共鉴定了1025个共有的UC相关基因(图1B)。此外,Limma用于表征UC与正常样品中的DEG,并筛选了2786个DEG,其中1624个上调基因和1162个下调基因(图1C)。排名前30位的DEG(按|log 2 FC|)显示在热图中(图1D)。随后,为了探索衰老在UC病理学中的意义,作者进行了Venn分析以整合DEG、UC和ARG,并最终确定了95个DE ARG用于进一步分析(图1 E)。此外,GSVA显示UC样品中JAK/STAT信号传导途径的异常活化(P < 0.0001,图1F)。JAK/STAT信号通路在免疫和炎症反应的调节中起着 ………………………………

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