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生信分析“零代码”来了!Cell的图照样零基础做

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2024-08-02 22:24
    

主要观点总结

本文介绍了生物信息学(生信)的火热程度以及如何利用生信提高科研效率。文章提到了TCGA数据库和相关的文献发表情况,强调了生信在临床医生科研中的应用价值。同时,文章还介绍了一个国内科研工具箱平台——科研者之家,该平台提供了生信零代码版块,具有强大的样本筛选功能和多种分析模块,为科研者提供了便捷的分析工具。

关键观点总结

关键观点1: 生物信息学的火热程度及应用价值

文中通过TCGA数据库和文献发表量的增长来展示生物信息学的火热程度,并强调了其在临床医生科研中的应用价值。

关键观点2: 科研者之家平台介绍

介绍了国内知名科研工具箱平台——科研者之家,该平台提供了生信零代码版块,整合了多个公共数据库,具有强大的样本筛选功能和多种分析模块,为科研者提供了便捷的分析工具。

关键观点3: 平台的特点和优势

平台具有用户友好的界面,可生成高清矢量图,提供原始数据下载,并针对每一个分析结果给出图例、方法学、结果的中英文对照和参考文献,为科研者提供全面的支持。


文章预览

作为科研者,如果你到现在还不知道 生物信息学 ,那真的太out了,生信有多火?拿最有名的数据库TCGA( Cancer Genome Atlas )来说, 目前已经收录了来自1万多例病人的33种癌症的数据,2.5PB的数据量。 在pubmed中随便搜一个TCGA,就可以发现近年来相关文献发表量在成指数级增长。 这其中,一部分是利用TCGA数据库发表的纯生信文章,比如 2018年4月 发表在Cell上的一篇 “ Comprehensive Characterization  of Cancer Driver Genes and Mutations ”。 也有很多利用TCGA数据库的图片给文章增色的, 比如 2019年3月4,耶鲁大学 陈列平 教授团队在 Nature Medicine 上发表题为 Siglec-15 as an immune suppressor and potential target for normalization cancer immunotherapy  的文章,里面就利用TCGA数据库分析了Siglec-15 和T cell signature genes (CD3E, IFNG, GZMA and GZMB) 在膀胱癌中的关系。 而这些都不需要额外的湿实验,大 ………………………………

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