R tips：ggplot2点图排序

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使用Seurat在UMAP坐标上绘制基因表达量图的时候，可能会遇到一个问题：由于单细胞的基因表达较为稀疏，而在细胞数量太多的情况下，可能会导致基因表达图几乎看不到趋势，这个时候可以考虑将表达量高的点优先绘制在上层以突出显示有表达量的细胞。 Seurat的order参数 Seurat绘制基因表达量的函数是FeaturePlot，它有一个参数order，可以根据基因表达量排序，让表达量高的细胞展示在上层，如下图所示： library ( tidyverse ) library ( Seurat ) all_data   readRDS ( "PATH OF YOUR SINGLE CELL RDS" ) p1   all_data  %>% FeaturePlot ( features  = "JAG1" ) p2   all_data  %>% FeaturePlot ( features  = "JAG1" ,  order  =  TRUE ) patchwork :: wrap_plots ( p1 ,  p2 ) 可以看到右图在添加了order参数后，JAG1的表达量比左图明显。 ggplot2对象的data slot 除了在绘图的时候添加order = TRUE之外，由于FeaturePlot函数返回的 ………………………………