噬菌体λ基因调控网络的彻底定量描述，稳健性、稳定性和效率：动态结构分析

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Robustness, Stability and Efficiency of Phage lambda Gene Regulatory Network: Dynamical Structure Analysis 噬菌体 λ 基因调控网络的稳健性、稳定性和效率：动态结构分析 https://arxiv.org/ftp/q-bio/papers/0403/0403016.pdf https://arxiv.org/pdf/q-bio/0403016 摘要 基于最近发展的复杂网络动态结构理论和Shea和Ackers在1980年代的开创性工作，我们为控制噬菌体λ生命周期的基因调控网络构建了一个透明且简洁的数学框架，该框架自然地包含了随机效应。动态结构理论指出，一个复杂网络的动态由其四个基本组成部分决定：耗散（类似于降解）和随机力、由势能决定的驱动力以及横向力。势能可以被解释为噬菌体发育的景观，包括吸引盆地、鞍点、峰值和谷值。耗散使得噬菌体在由势能定义的景观中具有适应性：噬菌体总是倾向于接近附近吸引盆地的底部。随机波动赋予噬菌体通过鞍点在势能景观 ………………………………