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三代测序原理详解

生信百科  · 公众号  · 医学  · 2017-10-14 22:34
    

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三代测序由于其超长的读长,以及无GC偏好性等的特性,在基因组学的研究中起到了越来越重要的作用。目前国内已经商用的主要是PacBio公司的RS II和 Sequel平台。Sequel平台作为RS II的升级版,由于其通量的提高,使得测序成本大幅度降低,也使得三代测序将逐渐成为科学研究的常用手段。今天我们就详细聊聊PacBio测序的原理以及与其相关的一些名词。 建库 Pacbio的文库构建分为3个主要步骤。 1.获取建库的DNA片段,这些DNA片段可以是基因组DNA也可以是cDNA或者是PCR产物。 2.进行接头连接,将修复好末端的DNA片段与通用接头相连接。由于接头是茎环状的,经过连接后的分子呈现出哑铃状结构,这种特殊的DNA形式有利于发挥测序平台长读长的特点(会在稍后提到)。 3.结 ………………………………

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