Mol Cell | RNA结合蛋白的时间分辨率图谱

撰文 | 亦mRNA在其整个生命周期中（如真核mRNA的转录、前体mRNA的加工、核转运、翻译和降解）会频繁更换其蛋白伴侣，与系列特定的RNA结合蛋白（RBPs）形成mRNA-蛋白质复合物【1,2】。但截止目前，还没有mRNA-蛋白质复合物重塑的时空数据。近日，来自韩国首尔基础科学研究所RNA研究中心的V. Narry Kim课题组在Molecular Cell上发表了题为Time-resolved profiling of RNA binding proteins throughout the mRNA life cycle的文章。通过联合使用脉冲代谢标记、UVA交联、poly(A)+ RNA分离和质谱等方法，作者获得了时间分辨率的mRNA相互作用数据，发现整体而言，mRNA结合的系列顺序与已知功能相匹配。为检测RNA合成过程中特定时间点与mRNAs互作的RBPs，作者采取脉冲追击法，即利用4sU对细胞进行代谢标记，再使用UVA照射进行紫外交联，收集细胞后进行裂解，利用oligo(dT)磁珠对含poly(A)的mRNAs进 ………………………………