PacBio 测序之下机数据

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    一开始拿到三代测序的下机数据时，一脸懵逼。怎么这么多文件？怎么没有raw data, clean data了？这些乱七八糟的文件都是干嘛的？今天我们就来聊聊三代测序的下机数据都有哪些，以及他们具体的格式是怎么样的（以sequel 平台为主）。 测序过程 SMRTbell     A adapter通用接头，两端的接头可以一样也可以不一样     B barcode(客户自己设计)     I insert 插入片段，即我们测序的目的片段     由于SMRTbell是环状的，测序过程是边合成边测序，因此可以沿着新链合成的方向不停地读取序列，读取一圈又一圈，直到聚合酶累趴下了… 测序结果     根据SMRTbell的形状以及测序的过程，我们容易知道，测序出来的reads如上图所示，由接头序列, 条码序列, 插入序列间隔线性分 ………………………………